完全静止的状态，好像在等待着什么。
伊丽莎白-格林被称作天然的病毒库，各种病毒的变异菌株在她的身上源源不断的产出。时间到了1980年，雷蒙德?麦克马伦博士创立了gentek，并成为了黑色守望的下属研究机构，他认为黑色守望短视，认不清黑光病毒的价值，于是重启黑光计划，并将伊丽莎白-格林转至gentec的研究中心，从她身上研究病毒的新进化品种，其中即有最为关键的dx-1118号病毒。
并在后来招募了“主角”艾历克斯?墨瑟，以及后来成为alex女友的卡伦?帕克，。之后，黑色守望发现gentek重启了禁忌的实验，意图弹压，此时的艾历克斯?墨瑟也察觉到了gentec公司对待某些知道过多科学家的方式，为了活命alex偷取了一小瓶病毒样品，希望以此为筹码换取自由，却在车站遭遇了前来拦截的便衣特工。走投无路的艾历克斯?墨瑟摔碎了瓶子释放了病毒，自己也被当场射杀。
由于是在车站，当时就有许多市民被感染，曼哈顿的大规模疫情暴发也就此埋下了伏笔。艾历克斯?墨瑟在车站被射杀的时候就已经身亡，接下来在停尸房醒过来的，大家一直在游戏中操控的东西根本不属于人类，它是破碎瓶中的病毒沾上艾历克斯尸体之后对其外形及性格的继承，游戏标题“原型体”也指的是他。在游戏的某关，也可以听到将军的话：“不！已经不能用'他'来称呼！应该是'它'！”后来的电话中，也可以看到艾历克斯和他的“合作者”的对话：“啊…你已经不是人类了，你是黑色守望者的病毒而已。”
游戏越发展下去，游戏的内涵也就越明了：人类对于自己犯的错误只是掩盖再掩盖，实在掩盖不住了，就不惜代价毁掉。而刚刚出生18天的病毒“alex”却知道要保护某些东西：保护自己的“妹妹”，保护人类文明不被毁灭。
不知多久的沉默之后我和师母再次四目对视，我忍不住大声问道，“师母难道在实验室里发现了某种远古病毒的踪迹？教授这次来大熊山的真正目的并不是天熊而是病毒？”
师母没有回答,不是师母不知道答案而是这个教授一直隐藏的真相我现在还不能知道.
病房里的气氛有些凝重,一切好像早都安排好的一样,我偏偏只会玩一个游戏,这个游戏偏偏是黑色守望,我突然很想笑可是这样很不礼貌,停顿了半分钟我转身来到窗前,透过窗子看向外面无边的黑夜.
我现在唯一盼望的就是教授快点好起来,我们快点解除隔离回到金陵,然后我才有机会有资格更加接近事情的真相.