清军前锋在占领遵义和川东部分地区后，因地方残破，到处是一片荒芜，粮食接济不上，只能回师。大西军摆脱了清军的追击，得以整顿内部和休养士卒。
大西军南下后出现的气象一新，孙可望等人本来可以把贵州作为基地，休整士马，建立政权。
但这个时候他们得知云南发生了沙定洲叛乱的消息后，立即决策挥师南下，直取云南。
沙定州的叛乱是一系列的事件的连锁反应。
1644年，张献忠攻克成都，引起了末代黔国公沐天波的警觉，沐天波命令参将李肖龙带领2000官兵前往会川卫防备张献忠军南下，同时命令武定土司吾必奎为李肖龙部声援，哪知道吾必奎和李肖龙两人早就有矛盾，此时的武定土司吾必奎预谋发动叛乱，准备消灭沐家这个世代镇守云南的家族，吾必奎害怕李肖龙，于是索性提前造反，由于此时云南承平日久，叛军一开始的进展相当顺利，但沐天波反应迅速，调集昆明城内的日、月、虎、豹四营官兵，以及守城之官兵和沐天波本人的亲兵加起来共有上万人，同时又调集石屏土司龙在田、嶍峨土司王扬祖、蒙自土司沙定洲、宁州土司禄永命、景东土司刁勋等人迅速攻杀吾必奎，叛乱被平息。
长舒一口气的沐天波可能想不到，这只是一场大难的开端。
由于大明势微，想在乱世中谋求好处的可不止吾必奎。
蒙自土司沙定洲，是王弄土司沙源的儿子，阿迷州土司普名声死后，老婆万氏改嫁沙定洲，自此之后成为沙定洲集团的核心人物之一，两土司合并为一，沙定洲实力大增，开始觊觎沐氏家族的权力，以及200多年以来所积累的财富，在平定吾必奎之后，各路土司军大多回到自己的地盘，但是沙定洲始终赖在昆明不走，想干什么，已经不言而喻了。
正如吾必奎所说“已无朱皇帝，何有沐国公？”朱明皇帝都完蛋了，沐家又算得了什么？
定洲领百人到黔国公府上告辞，突然发动袭击，四下放火，昆明城内潜伏的沙定洲之兵见到黔国公府内火起，随即夺取南门，登上鼓楼鸣号，然后在城内放火，昆明城内此时已经是一片大乱，沐天波根本就组织不起来任何有效的抵抗，只能和几名亲兵带着印信仓皇逃出昆明，他的母亲和妻子没有逃出，被迫自尽。
沐氏家族300年所积累的财富就此全部落入沙定洲之手，珍宝被叛军全部运走，而沙定洲本人也有一统云南之意，先是胁迫云南巡抚吴兆元向福建的永平朝廷发假消息，声称自己“平定了沐天波的叛乱”，而沐天波已经逃到了楚雄，汇合金沧兵备道杨畏知，击溃沙定洲的追兵。但是不久，云南全境除了楚雄以西的地区之外，已经全部被叛军攻占，沐天波、杨畏知毕竟手头的兵力只有3000人。