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而军管会建立的自卫军更是来源驳杂，一百八十名高薪聘用的葡萄牙雇佣兵，三百五十名流亡的日本切之丹武士，六百人规模的武装水手，其余都是各华人港主的家丁和亲卫队，一共一千三百人，其中一半的人拥有火绳枪或燧发枪，还有四门三磅炮和六门八磅炮作为炮火支援。
组织军队耗费了大量的时间和精力，以至于没有足够的时间来构筑工事，李为经招募的丁壮在农集河南岸竖起了栅栏和胸墙，然后用椰树干和泥土构筑了两个炮台，把八磅炮安置在里面，把农集港区和城市掩护在了后面。
虽然北大年华人军管会由李为经和何文希控制，但是二人都不是军事将领，军队和舰队必须交给专业的人士，舰队的指挥官是航运公司的舰队长官，虽然隶属国有公司，但是从指挥官到军官、陆战队员都是现役军人，只不过不穿军装罢了，倒也不是什么问题，而陆军的指挥官则是葡萄牙雇佣兵的首领，加西亚，这是一个三十八岁的老兵，九岁就加入军队成为了杂役，逐渐成长为胸甲长矛手、火绳枪手、队长、侍从官，然后在首领死后加入了接管了权柄。
加西亚的军队作战足迹遍布南洋和印度洋，与很多敌人作战过，原本他们在马六甲为荷兰人服务，北大年女王雇佣了他们前来，李为经出的高价成功把加西亚留下来，雇佣兵们作战专业而实力强横，在优势的情况下也值得信任，更让人放心的是，加西亚曾经去过澳门，知道合众国的力量，在合众国远征舰队马上抵达的境况下，他们的忠诚度也在合理范围内。
到了第八天的早上，天方教的大军终于抵达，数量比预料中的要多，约有四千五百人左右，还有超过两千人的奴隶，规模巨大的军队从沿海和内陆的两条道路涌来，举着各式各样的旗帜和牌子，那些旗帜在放干水的稻田里招展开来，看起来颇为壮观。
敌军从内陆的丘陵一直延伸到海岸边，随着海螺声起伏不定，一面面不同的旗帜竖起来，继而是士兵的呐喊和战象的吼叫，声势颇为骇人，李为经皱眉说道：“好像和想象中的不同，你们见过军阵如此严整的土著军吗？”