荷兰人拥有信仰自由的权限，但不允许强迫其他人，包括合众国人和当地土著信教，也不得向当地原始部落传教。
而在香料群岛，合众国把安汶岛租借给了荷兰人，享有与西爪哇一样的权力，但特许东印度公司继续垄断香料群岛的香料贸易，只是所得香料中，合众国商人有三分之一的采购权，而香料群岛的所有土著都不得与荷兰东印度公司建立有政治关系，与在西爪哇租界一样，荷兰人不得规定官方语言，也不得强迫土著学习荷兰语言、文字。
马特索尔科对其中的一些条款进行了改变，主要是宗教、租界费用和行政法令上，比如，马特索尔科拒绝给所有合众国商人法外治权，只给了外交和军事人员这些权限，但是在一些问题上，李明勋是不会让步的，比如除了巴达维亚的使馆区这一相当于荷兰国土的区域，荷兰人不得随意使用尼德兰国旗和东印度公司的旗帜。
实际上，东印度公司和荷兰商人的主要利益也就在这两块租界之中，其余荷兰据点的资产，合众国承认其资产合法，但继续经营必须遵守合众国法律，因为合众国对外国国籍人士严苛的宗教和税务法律，大部分荷兰人选择离开这些据点，前往租界内继续经营，也有的选择加入合众国国籍，彻底融入东方这个多民族国家。
与法国人一样，尼德兰失去了可以失去的一切，获得的东西却是意想不到的，旁的不说，东印度公司几乎获得了半个爪哇，要知道，马特索尔科在这之前也仅认为，可以通过谈判保住巴达维亚和周边三十里的那些种植园罢了，结果超乎了马特索尔科的预料，而李明勋的大度也需要马特索尔科的回报。
“总督阁下，我想，这个协议达成之后，很长一段时间内，贵国与我国，贵公司与我国商人会处于和平状态了，为了庆祝难得的友谊，您不应该把和我们敌人的那点龌龊公之于众吗？”李明勋拿出一瓶法国红酒，微笑问道，所谓的敌人，自然指的是满清了，李明勋很想知道，满清与东印度公司这两个敌人所筹划的反华联盟究竟会如何操作!