这时萧绰进账，她慌忙之下，吞下了那只金鸡。没想到这金鸡，却是鸡状的神药。过了几天，萧耨斤居然脱胎换骨，变得光彩照人。萧太后惊异说道：“你日后一定能生下奇子！”于是她命令耶律隆绪与其同房。开泰五年，萧耨斤果然生下一子，取名木不孤，也就是耶律宗真。
不久，耶律隆绪封萧耨斤为顺圣元妃，但她毫不知足。她野心勃勃，傲慢无礼，在多次陷害皇后萧菩萨哥无果直后，便暗中收罗亲信，培植势力。耶律隆绪临死前，告诫萧耨斤说道：“我死了之后，你别怨恨皇后。你是太子的生母，我也不会亏待你。皇后虽尊为齐天太后，你为皇太妃，但我会打破惯例，以你为法天皇太妃。
耶律隆绪病重的时候，萧耨斤当即辱骂萧菩萨哥道：“老东西，福将享尽了吗？”耶律隆绪听说之后，召来耶律宗真，叮嘱道：“皇后服侍我已经四十年，因为她没有儿子，才以你为嗣。我死后，你们母子不要伤害她，这是要紧事情！宋朝重信，你只要固守，他就不会生衅，终当和好，国家自可无忧。”耶律宗真唯唯受命。
耶律隆绪已死，萧耨斤自称太后，参预国事。左右之人秉承萧耨斤的意旨，污蔑萧菩萨哥的弟弟谋逆。萧耨斤派官审讯，牵连到萧菩萨哥。耶律宗真说道：“先帝的遗命，怎可不遵？何况她曾经抚育过朕，恩勤备至。如今不尊天为太后，反而要加她罪名，如何使得？”
萧耨斤道：“此人不除，必为后患。”耶律宗真说道：“她没有儿子，又已经年老，能有什么异图？”萧耨斤不肯答应，竟然命人把萧菩萨哥迁去上京。耶律宗真发使到宋廷通报，宋朝派遣中丞孔道辅等人充贺册及吊祭使，南北通好，仍然照常。
明道元年，辽主耶律宗真去雪林打猎。萧耨斤担心耶律宗真怀念养育之恩，就急速派人前往上京加害萧菩萨哥。使者到了之后，萧菩萨哥说道：“我确实无辜，天下人共知。你等我沐浴一下身子，然后去死，可以吗？”使者退下。待到回来，萧菩萨哥已经服毒自尽，终年五十岁。
被此事牵连以及囚禁处的卫士一百多人，四十多名贵族大臣被杀，家产籍没。眼中钉除去后，萧耨斤更加胆大妄为。中书令萧朴上书为萧菩萨哥诉冤，被赶出了朝廷。她不但把弟弟们都封王，还让四十多个奴仆也当上了高官。
萧耨斤的姐姐秦国夫人早年丧父守寡，难耐寂寞，常干些偷鸡摸狗的勾当。萧耨斤见长沙王谢家奴长得魁伟俊俏，就杀死其妃把自己的姐姐嫁给了他。萧耨斤的妹妹晋国夫人看中了一表人才的户部使耿元吉，萧耨斤就杀死他的妻子，强迫他娶了自己的妹妹。在不到一年的时间里，萧耨斤几乎把萧太后与耶律隆绪
的改革措施全部废弃。
萧耨斤的权力欲望膨胀，甚至把耶律宗真的一举一动都置于自己控制之下，使得母子关系变得非常紧张。萧耨斤担心宗真亲政后，自己权力会有所剥夺，于是与萧孝先兄弟合谋，企图废掉宗真，另立自己的小儿子耶律重元。