四砦、九堡，在铜佛坝设立南平军。朝臣评议熊本的功劳，打算加授他天章阁侍制的官衔赵顼说道：“熊本的文采，我是知道的，应当让他负责写诏书。"于是，熊本被加授制诰一职。
随着新法的推行，朝廷中亲旧两派斗争日益白热化，面对变法改革中的激烈纷争，熊本上疏赵顼劝谏他要坚持变法。熙宁十年，新党官员都水丞范子渊用"浚川耙"治理黄河，取得巨大成效。旧党的文彦博认为不可能，宋神宗就派熊本等人去考察。
熊本回来后，表示赞同文彦博的说法。范子渊于是请求拜见皇上，说熊本等人看到王安石被罢相，臆测文彦博将为宰相，故意附会文彦博的说法。赵顼于是委派蔡确和黄履办理此案，蔡确也弹劾熊本等人受命考察时不守法纪。
于是王安石上奏，将熊本调到西京任职。熊本在洛阳呆了三年，才被重新任命为滁州知州，后改任广州知州。元丰五年，召为工部侍郎。回京途中，因为宜州发生叛乱，他被任命为龙图阁待制、桂州知州兼广西经略使，前去宜州处置战事。
熊本到了宜州，谕示各个溪峒的酋长要安分守己，告诫宋朝驻守边疆的官吏将士不要惹事生非。同时，上奏朝廷选将练兵，多买战马充实骑兵，增强戍守力量。由于他采取了有效措施，宜州相安无事。当地人蔡宝铨煽惑龙蕃与峒户相互仇杀，然后想引兵攻讨以为功。熊本质问蔡宝铨，看他神色有异，当即将他捆绑起来投入江中。蛮夷畏服，敬以为神。
宜州与交趾相邻，当时朝廷承认交趾国主李乾德据有顺州，但疆界没有划分清楚。交趾因此经常侵掠勿阳，驱逐在此地的侬智会。侬智会到宜州来求援，熊本发檄文质问李乾德，李乾德连忙收兵向熊本谢罪。为了明确疆界，消除战乱，熊本请求将宿桑八洞这片不毛之地划给交趾，从此西南边疆得到安定。
转运判官许彦先建议把湖南盐销售到广西，按人口卖给百姓，每年可得钱三十万。熊本说道：“桂州民贫地瘠，恐怕承受不了。"许彦先的建议于是被搁置。后来，熊本被召入京城，升为吏部侍郎。
王韶收降俞龙珂之后，又替俞龙珂请求赵顼赐给他姓氏。俞龙珂自己说中国有包中丞，忠清无比，愿附他的姓为荣。赵顼于是赐俞龙珂姓包，改名为包顺。包顺因此带着王韶深入蛮地，王韶于是和都监张守约，就在古渭寨驻戍守，定名通远军，作为根本。
王韶自幼丧父，成为孤儿。他善于用兵，极有谋略。每当带兵出去作战，都事先把部下各将领召集起来，告诉他的作战计划，然后再也不过问了，而每次战斗都能取胜。有一次夜晚，他在帅部帐中睡觉，部队前锋与敌人发生遭遇，双方发生激战，
箭石如雨，杀声震天，军部那些侍者都颤抖不已，而王韶仍安然酣睡。
他在鄂州任上，设宴待客。家中姬妾奏乐给客人听时，客人张缋酒醉，拉着一位姬妾想拥抱她。姬妾痛哭流涕，