他搬出高太后，自然没法反对。
高太后又召吕公著为侍读，吕公著自扬州进京，擢升为尚书左丞。京东转运使吴居厚，接替了鲜于侁的职位，大兴盐铁，因此被弹劾，谪置黄州，仍用鲜于侁为转运使。司马光对同僚说道：“子骏甚贤，不应让他居外。朝廷想救京东困弊，非得子骏不可。他是一路福星。当今人才甚少，怎能得到像子骏一样的一百人，而散布天下！”原来子骏就是鲜于侁的字。
鲜于侁一到任，就上奏罢除莱芜、利国两冶，以及海盐依河北通商。于是司马光、吕公著两人，把新法全部废除，无论好坏。他们罢保甲，罢保马，罢方田，罢除市易。又削了前市易提举吕嘉问三秩，贬为知淮阳军。次年，改为元祐元年。右司谏王覿，大力攻击蔡确、章惇、韩缜、张璪等参与新法的人。右谏议大夫孙觉、侍御史刘挚、左司谏苏辙、御史王岩叟、朱光庭、上官均等人趁机落进下石，接连弹劾蔡确。
司马光大喜，于是撺掇高太后免掉了蔡确相位，出知陈州。高太后极为欣赏和信任司马光，于是升司马光为尚书左仆射兼门下侍郎。高太后又任命吕公著为门下侍郎，李清臣、吕大防为尚书左右丞，李常为户部尚书，范纯仁同知枢密院事。至此，朝中全部换成了反对新法之人。
当时司马光已经有病，因为青苗、免役等新法，还没有全部废除，西夏和议也没有谈好。他不禁叹息道：“诸法没有废掉，我死也不能瞑目。”于是写折简给吕公著，说道：“我以身就医，已经把家事交给儿子。只是国事还没有着落，特以托付给你。”吕公著于是禀告了高太后。
高太后于是下诏免了司马光的朝觐，特许他乘肩舆入朝，三日一次。司马光不敢当，上奏道：“不见天子，如何理事？”高太后又改令司马光的儿子扶着他入朝，还免除拜跪之礼。司马光于是请求废除王安石的青苗、免役二法，恢复以前的旧法，诸大臣自然不敢有异议。
免役法被废除之后，司马光又请求恢复差役法。章惇极力反对，与司马光当殿辩论。高太后勃然大怒，把章惇逐出京城，贬为汝州知州。这时苏轼已奉诏进京，担任中书舍人，请求行熙宁初的给田募役法，声称有五大利处。监察御史王岩叟却说五利没有，却有十弊，因此苏轼的建议没得到采纳。
群臣又各行其是，高太后又下令资政殿大学士韩维、吕大防、范纯仁等人详细商定后上奏。苏轼本来和司马光关系极好，于是去见司马光，说道：“公想改免役为差役，我看两害一样，没有看到有什么益处。”司马光问道：“有什么害处？”
苏轼答道：“免役的害处，是在于收敛民财，以至于十室九空。敛从上聚，下面必常患钱荒，这害已经验过了。差役的害处，是
百姓常受役官府，无暇农事。贪吏猾胥，随时征比，相继为奸，岂不是异法同害吗？”司马光又问道：“依你的高见，应该如何？”
苏轼说道：“法有相因，事乃易成。事能渐进