此举遭其部宁兵备佥事袁崇焕、孙元化等坚决反袁孙等认筑城“非策”极劝阻并向首辅叶向高申诉叶向高难断定否孙承宗遂提往实考察再作决断抵达山海关与王晋争论昼夜最终否定王晋固守山海关战略
启年月孙承宗任命辽东经略始实行堡垒进攻战略修筑宁远城部署关宁防线练兵十万结果柳河、凌河场战斗数万军阵金几百、几千打败损失惨重孙宗因此职
次兵金入犯京师崇祯情急又把孙承宗召回官复原职又兼兵部尚书负责北京城防卫工作
崇祯听孙承宗脸色稍微顿顿崇祯又问“袁崇焕否招供”
其袁崇焕狱经月崇祯元年位蓟辽督师任曾崇祯许重诺年期平定辽东崇祯因此赐袁崇焕全权举凡户部转运军饷工部供应器械吏部用兵部调兵选将悉由袁崇焕决袁崇焕任将宁远、锦州合镇祖寿镇守锦州赵率教守关门袁崇焕率何刚驻宁远随即斩杀皮岛抗金将领、东江总兵毛文龙似意图与金议和毛文龙世金直其军事骚扰暇南犯毛文龙死金腹患解除几月皇太极率军破边入犯京师
皇太极军破边袁崇焕急率关宁铁骑回卫京师崇祯随即旨由袁崇焕统领各路勤王师抗击金防卫北京袁崇焕调兵遣将破绽至于金军路攻城略兵锋直达京师城北京城保卫战袁崇焕所部与满桂部谐甚至满桂率军与金作战背放箭射伤满桂举皇太极因此借打巧用离计致使北京城内轰传袁崇焕勾结金引兵入犯舆论哗
崇祯于召袁崇焕进城当质问袁崇焕何杀毛文龙何敌军入寇何箭射满桂
崇祯和旁挂箭伤满桂袁崇焕沉默语崇祯于怒令将袁崇焕当场拿投入监狱
“袁崇焕案遵旨由锦衣卫指挥刘侨负责查办提审原兵部尚书王洽查验王洽和袁崇焕往书信其并与袁崇焕同谋斩杀毛文龙及行款鞑虏情事斩帅、行款袁崇焕供认皆其所……”孙承宗低酙酌字句缓缓
袁崇焕孙承宗学启年王晋经略辽东主张放弃辽锦重兵退守山海关防线与袁崇焕固守辽锦防线伺机复辽主张重战略分歧决定明朝死存亡重战略抉择际孙承宗支持袁崇焕主张亲山海关与王晋辩论并最终启皇帝支持罢免王晋辽东经略将王晋调任南京兵部尚书闲职
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