斯特领导的动画部门开始为其他公司提供电脑动画制作服务。同时皮克斯保持了同迪斯尼动画紧密联系。一九九一年，在公司一次大裁员之后，接到了迪斯尼动画的一个订单。迪斯尼动画作为制片方投资两千六百万美元，由皮克斯制作三部电脑动画，第一部为《玩具总动员》。尽管得到了迪斯尼的订单，由于长期不能盈利，史蒂夫-乔布斯最终还是决定出售皮克斯。
直到迪斯尼同意将玩具总动员推到一九九五年的暑期档发行之后，乔布斯才决定暂停出售，给皮克斯最后一个机会。只是令所有人没有想到的是，《玩具总动员》播出之后竟然大获成功，全球票房达到三亿五千万美元这才让史蒂夫-乔布斯放弃了出售皮克斯的计划，转而专心的与迪士尼合作，搞起动画来。
不过，据艾克曼所知，虽然在去年上映的《玩具总动员》票房大卖，但是皮克斯实际上并没有赚多少钱。因为《玩具总动员》虽然是皮克斯制作完成的，不过，这部长片动画却是迪士尼委托皮克斯制作的，就是说这部动画的版权属于迪士尼，皮克斯不但得不到动画周边所产生的利润，在票房方面，他们也得不到任何分成，只能拿合同中规定的制作费而已
皮克斯仍然一如既往的处在缺少资金的尴尬状态。虽然如此，史蒂夫-乔布斯却看到了希望，凭借《玩具总动员》打出的知名度，史蒂夫-乔布斯随即把皮克斯上市，以此达到筹措资金的目的。果然，上市后，股价在很短的时间里便翻了一番，史蒂夫-乔布斯如愿以偿的得到了一大笔资金。
当然，这些并不是艾克曼看上皮克斯的理由，在他的记忆中，皮克斯从明年上映的《棋逢敌手》开始，将会一发而不可收拾，基本上每部动画长片都会获得奥斯卡的提名，并且票房也是全部大卖，这简直就是一个奇迹
一九九六年，约翰-拉萨特获得奥斯卡特殊成就奖，《玩具总动员》获得奥斯卡最佳配乐(音乐喜剧类)、最佳主题曲、最佳原著剧本提名，同年还获得金球奖音乐喜剧类最佳影片及最佳主题曲提名。
一九九七年，皮克斯与迪士尼达成进一步协议，决定强强联手共同制作五部动画长片。皮克斯发行短片《棋逢敌手》，本片在动画角色的皮肤及服装材质上有了很明显的优势。
一九九八年，迪士尼与皮克斯合作的第二部电脑动画长片《虫虫危机》上映。《虫虫危机》在北美共有一亿六千三百多万美元进账，全球票房为三亿六千二百多万美元，击败了同期推出的梦工厂《蚂蚁雄兵》，成为当年动画长片票房冠军。同年，《棋逢敌手》获得奥斯卡最佳动画短片奖，皮克斯研制的动画系统和数位绘图技术获得奥斯卡科学工程奖。
一九九九年，世界上第一部完全数码制作的电影《玩具总动员2》上映，在美国、英国、日本等地先后打破首映周票房记录。这部迪士尼与皮克斯合作的第三部电脑动画长片的内容及人物都接续《玩具总动员》。凭借《玩具总动员2》两亿四千五百多万美元票房的