优势战胜了扎基。
但异生兽还未灭绝！
蠢蠢欲动的黑暗，让诺亚不敢大意。谷一辉通过tlt内部档案知道，石堀队员并没有消失，他似乎吸收了扎基的能量。
他究竟是谁？
扎基已死，为何石堀犹存？
然而这个人太神秘了！
自从扎基一战后，世上仿佛没有“石堀”这个人，无论谷一辉怎么寻找，始终找不到他。
然后便过了三年！
姬准重操旧业，参加中海摄影大赛夺得了金奖！千树怜辞去了tlt职务，回到游乐园陪未婚妻经营餐厅。
西门凪恢复了！
她被提拔为夜袭队队长，谷一辉担任副队长，两人作为金牌搭档，在这三年里将“异生兽”带来的危害降到最低，人类社会恢复安宁。
但谷一辉仍旧不安。
诺亚的光芒告诉他，黑暗从未消失过，眼前的安宁祥和不过是一片假象。
当他约西门凪见面，决定好好谈谈时，他拼命寻找的“石堀队员”却出现了。
“很意外么？”
石堀笑了笑，端起红酒杯一饮而尽：“我获得了比梅菲斯特和扎基更强大的力量，看啊诺亚，这便是我……”
黑暗路西法出现了！
令人灵魂颤栗的黑暗巨人，光是看一眼就会堕入黑暗。
“光是不会消失的！”
“奈克瑟斯！”
谷一辉没有选择，只能拔出进化信赖者，在黑暗中变身为银白光辉交织的巨人——诺亚。
这一战太难了！
没有双翼的诺亚，面对集合“梅菲斯特与扎基”等黑暗源头的路西法，登场便落入下风。
路西法很得意！
他告诉诺亚，他等这一刻已经等了很久很久。所谓的浮士德、梅菲斯特等事件，全都是他在幕后主导，为的便是“促进觉醒”。
“觉醒……到底是什么？”
谷一辉苦苦支撑，却始终不敌黑暗路西法，战局陷入崩盘边缘。
直到他再一次，回想起溺水时向他伸出的那只手：“不要放弃！”
“准哥？”
“不，你不是准哥！”
谷一辉很痛苦，他仿佛想到了一切的根源，那只手真的是姬准吗？
“诺亚，是你么？”
“回答我，诺亚！”
死寂的黑暗领域中，无人响应谷一辉的疑惑，直到那一对炫目的时空之翼展开……
诺亚在时空之翼的庇护下站起身，缓缓说道：“结束了，路西法！”
“不！”
“这不可能！”