聊完疟疾，朱慈炫又说起鼠疫：“吴卿，疙瘩瘟的危害远大于打摆子病，是种急性传染病，死得快，传染得更快。一旦爆发，须当机立断，在隔离病人的同时，立即进行区域封锁，防止病毒外泄。”
作为《瘟疫论》作者，对畏之如虎的疙瘩瘟，自然洞若观火。
“陛下圣明，治疗只能活一人数人，而隔离、封锁则活成千上万人，来不得半点马虎。”
谈起医学问题，吴有性轻松自如：“陛下放心，臣亦当竭尽全力，完善治疗疙瘩瘟的方子。”
记得达原饮主治疟疾和瘟疫，朱慈炫于是点拨道：“吴卿，打摆子病和疙瘩瘟皆为热病，可考虑先用同一方子治疗，而后再按病种优化。”
吴有性眼睛一亮，喜道：“陛下，臣正有此意。”
“吴卿，朕以为治病有两种方法：一是直达病灶，杀死病毒，修复病体；二是培本固元，增强抵抗力，杀死病毒，修复病灶。卿等研制处方，可参考此思路。”
吴有性听完，细细思索一番，随即又喜道：“陛下，您真神人也！”
摆摆手，朱慈炫谈起卫生部事务：“吴卿，对卫生部政务，可有思之？”
昨日颁布圣旨，今日就觐见，问卫生部事务自然少不了，吴有性与几名弟子谈论了大半夜，有一定准备。
听乾圣问起，他立马回道：“陛下设立卫生部，想必是对太医院不满，要另起炉灶。”
从泰昌到天启，皆医治无效，再到自己被太医行刺，朱慈炫对太医的厌弃理所应当。
但他对太医更多的是失望。
中医需要经验累积，可朱元璋制定的太医世袭制度，却令良医流于民间，太医院反而庸医成堆，效果适得其反。
当然，所有的世袭制都有这通病。
他回道：“吴卿，上书房是新体制，可以承继旧官衙，亦可平地起高楼。太医院有可取之处，卿自可延用，不妥之处当唾弃不用。”
“臣明白。”吴有性点头道，“臣会从太医院选拔有用之才，也会从民间征召良医，集中大明良医，攻克打摆子病和瘟疫的治疗处方。”
从民间征召良医，会影响地方就医，但朱慈炫也顾不了许多，心下默许。
等了一会，没听他继续，反而眼望着自己，朱慈炫知道吴有性能想到的就这点。
他轻笑一声道：“吴卿，卫生部不是太医院，而是从一品的衙门，不仅需要研制治病处方，更重要的是卫生管理。”
“如何管理？陛下。”吴有性有些懵逼。
对此，朱慈炫也有自己不成熟的想法，于是与吴有性探讨起来，最后达成三点共识。
第一点，卫生部通过设立下派衙门，自上至下实行垂直管理，同时也协助地方衙门管好卫生医疗事务，犹以传染病防治事务为重。