在平地与装备精良的明郑军队作战，番军除了败退还是败退，一直被明郑军队追赶至番国腹地后，番王才回过神来。
但此时南北两部明军已成功会师，大肚番国内的许多番社纷纷投降，只剩下番王仍带领着十几个死忠的番社仍在顽抗，但难改大局。
坚持顽抗近一个月后，大肚番王被手下合谋杀死，残部投降了东宁。
此役彻底除名番社三十一个，七十五个番社只剩老幼，完整投降的番社有六十八个，明郑军队伤亡战士总计一千七百余人。
至此西侧平原的平埔番社被尽数拔除，鸡笼至承天府的陆路通道由此打通。
而让郑克臧意外的是，在大肚番国内发现已有开垦好的良田近三万亩，郑克臧安排最先投降的番社挨个登记户籍，造印田册，继续耕种此处土地。
其余战俘则尽皆贬为番奴，开始了他们的第一份工作，修筑承天府至鸡笼的官道。