副武装骑士的护卫和簇拥下，小阿尔马格罗穿着总督的礼服，来到了挤满人群的广场，在军号声经久持续的吹奏声中，由法官宣布小阿尔马格罗为秘鲁总督和当地政府的首领。
而此时，皮萨罗和堂兄阿尔坎塔拉、副官查维斯，还有那几个卫兵的死首还停放在血泊之中。他们的尸体因为被砍得血肉模糊，几乎让人辨认不清。有人就站在广场上高声喊道，“把那个恶霸和同党的尸首吊在绞刑架上示众。”顿时，广场上就有许多人跟着喊了起来，“把那个恶霸吊起来示众。”
听到喊声，小阿尔马格罗吓了一跳，就马上把胡安·德埃拉达叫到身边，对他低语说，“别让他们这样做，要不，你去让他们的亲人和家人把他们的尸首快快地埋了，免得夜长梦多。”
胡安·德埃拉达也觉得不能这样做，因为这样很容易引起皮萨罗同伙和同党的血腥报复。他对小阿尔马格罗说，“已经有人来请求了，要求把他们的尸体快快的掩埋，因为天气很热，很容易腐烂发臭。”
小阿尔马格罗说，“就让他们快快地掩埋，就说是我批准的。”
胡安·德埃拉达说，“我马上派人去通知他们的家人。”说着，便把身边的一位士兵叫到了身边，对他低声耳语了几句。那个士兵就偷偷地跑到了皮萨罗的家中，把这个消息告诉了皮萨罗的那个妻子，也就是那个印加公主。印加公主和一位忠诚的仆人带着几个黑人家奴用一床棉被把皮萨罗的身体裹着。而其他那些人的家人也都秘密地接到了通知，把阿尔坎塔拉、查维斯和那些卫兵的尸体用毛毡包裹着带走了。
为了保密和不被人注意，他们一直等到天黑之后，才把皮萨罗的尸体让人抬着来到了大教堂。在几枝小腊烛微弱的烛光下，他们雇人在教堂一个昏暗偏僻的角落挖了一个坑穴，将死者的尸体裹着紫色丝绒的毛毡里，装进一个绑着金制丝带的大木箱里，然后匆匆地下葬。在场的只有他的妻子和几位十分卑微的仆人在为他祈祷。这就是这个秘鲁征服者的悲惨下场。
可是，就是这个人，在一天之前，还在这块土地上称王称霸，就跟这块土地的世袭君王印加王一样施行着专制独裁的统治。可他却在光天化日之下，在他自己首府的中心，却被那些曾经的同伙，并与他分享过他的胜利和战利品的人们，要去了他的性命。他像一个可怜的被遗弃者一样死掉了。甚至没有一个人说一声“上帝饶恕他”。
几年之后，当这个国家恢复了平静，皮萨罗的遗体被重新安放在一具豪华的棺木里，埋在大教堂引人注目的一座纪念碑下。到了1607 年，也就是在他死去的第53年那年，和平友善的气氛就像帷幕一样将过去笼罩了起来。这时，人们已经渐渐地忘掉了他的罪恶和过错，而想起了他在殖民扩张过程中对西班牙及其王室所做出的巨大贡献，考虑起他应该所享有的崇高威望，于是，将他的尸骨又移放在了新教堂之中，并准许将他的尸骨与秘鲁英明而有威望的总督门多萨的尸骨并排安放。