军务部之下，另设置海军司。
司首为阮小七，
在军务部的领导下，主管海军编制、建设和力量部署。
下设黄海（驻地高丽江华岛，隶属于登州军区）、
渤海（驻地辽东镇东关，隶属于辽东军区）、
东海（驻地海东藩州，隶属于海东军区），
共三支舰队。
舰首分别是阮小七（暂代）、张顺和熊蒙。
掌管舰队日常训练、管理和所辖海域的巡防。
徐泽军政一肩挑，难免会有精力不足，甚至疏漏的地方。
为此，又在社务部和军务部之外，
设立秘书室，
室首暂由杨喜代理，
掌管机要、省阅文书﹐传达命令等。
除了改组机构外，
针对各地行政机构设置不合理的问题，徐泽也进行初步调整。
海东郡，
南北各置一州，分别命名为藩州、篱州，
取自贾谊《过秦论》：“乃使蒙恬北筑长城而守藩篱。”
以示海东为中华之屏障，万世不易之意。
辽东，
来苏、怀化、顺化城三地合为一州，
更名为海连州（北宋广南东路设置有连州），
意为辽东与登州隔海相连，永为中华之土。
镇海府与穆州合并，更名为燕州，
以纪念千余年前，春秋之时，燕国首开辽东之举。
宁州与复州合并，更名为复宁州，
以区别大宋已有的宁州和复州两地。
徐泽从来都不是一个固步自封的人，
他相信世界上唯一不变的，就是一直在变。
因此，同舟社成立以后，
组织结构和社规从来都没有固定死。
随着人数不断增加，形势不断变化，
其组织结构也不断做出符合形势发展的调整。
这一次改组，同以往的调整相比，
本质上并无区别——都是为了适应形势发展的需要。
但这次的调整，又有明显的不同。
同舟社第一次明确设置了自己的军政运转体系，
军事、政治、外交、经济、农工商、文教等等，无所不包，
此次改组，为以后改社建国迈出了一大步，
徐泽已经毫不掩饰自己的雄心和壮志。
至于因此而带来各方更多得关注，徐泽并不怎么担心，
毕竟，此时不是元末天下反王遍地，
先