旁遮普的德里军队中有很多原花剌子模旧部，这些花剌子模军人本来就对因摩诃末失误政策所导致的失败窝了一肚子火，眼下见蒙古人又来了，便个个奋勇当先斩杀蒙古兵。
蒙古军初来印度，还不适应此地炎热干燥的气候，眼下又遭遇视死如归的花剌子模战士，一时军心大乱，纷纷败退溃逃。
此时的德里苏丹伊杜米思不愧是一个政坛老手，他眼看武力抵抗取得了初步成功，便进一步拿钱财贿赂了一些蒙古军官，又派遣间谍散布谣言，瓦解蒙古军的士兵。
与此同时，扎兰丁的大军又在别处推翻蒙古人的统治。蒙古军队遭收了较大损失，无心再打下去，便撤退了。
此后一段时间，蒙古忙于继续与花剌子模作战、进攻西夏、消灭金朝残余、组织西征等战争，便暂时放弃了对印度的入侵。
1246年，完成西征大业的蒙古军踌躇满志，便再次发动了进攻印度的战争，从这一年开始，蒙古军队不断入侵印度河流域。
但此时德里苏丹国经过几代君主的经营，实力已更加强大，因而蒙古的每一次入侵都被挫败。1266年，巴尔班成为了德里苏丹，这位穷兵黩武的统治者决定要终结蒙古人对印度的入侵。
正好此时（13世纪中叶）蒙古帝国分裂为后来的四大汗国，实力已大大不如从前。最终，巴尔班将蒙古军队打得大败，蒙古对印度的第二阶段入侵以失败告终。
在分裂之后，蒙古帝国的实力衰弱了，几个汗国之间经常相互攻伐，其中察合台汗国领有中亚地区，由于东西两面被元朝、伊儿汗国与金帐汗国遏制，所以察合台汗国只得选择印度为扩张方向。
在1290—1296年，蒙古军三次侵略北印度，此时蒙古本部兵马已经有些捉襟见肘，只得征发大量的仆从军随同作战，这些仆从军本是就对蒙古统治不满，战场上一旦有时机便开小差、溜号甚至倒戈。
此时的德里苏丹贾拉尔丁又是一位有所作为的君主，所以蒙古的这次入侵毫无疑问失败了。
此后察合台汗国又发动了几次对印度的进攻，但力量一次比一次弱：
1297年，都哇率领蒙古军洗劫旁遮普，但被击败。
1299—1300年，忽都鲁·火者率领蒙古军洗劫北印度。
1303年，12万蒙古军（包含大量仆从军）企图直扑德里，但两个月仍未攻下该城，最后由于损失惨重而撤退。
1304年，4—7万蒙古军队再次入侵北印度，在阿姆罗赫与德里苏丹将领图格鲁克展开会战，图格鲁克大获全胜。战后，9000—10000名蒙古俘虏被战象踩死。
1305年，怯别入侵木尔坦地区，被图格鲁克彻底击溃。幸存的蒙古战俘几被杀戮殆尽。最终察合台汗国在内忧外患下停止了对印度的入侵。
蒙古近一个世纪对印度的多