就算了。
但是没想到，几年后京城又传出一份小字报《续忧危竑议》，把郑贵妃企图争位的事挑明了说。
万历气蒙了，要求东厂、锦衣卫限期破案。
锦衣卫到处抓人，抓了审，审了抓，株连了很多人，搞得朝野鸡飞狗跳。内阁大臣也被拉下水。但审来审去也没审出个结果。最后，锦衣卫在限期到来之前抓到一人，将其认定为主犯，把这个案子草草结案。
万历下令将主犯凌迟处死。
这个案子把吕坤折腾得够呛。他原本只是想警醒皇帝大明江山已经到了最危险的时刻，没想到卷入一场文字狱里面。而这个文字狱不是皇帝掀起的，而是同僚掀起的。文字狱让他饱受攻击心力交瘁。他实在待不下去了，借口生病辞职回家。他在家乡办了一个书院，传授阳明心学，后来成了一个哲学家。
这个案子被称为“妖书案”，在当时影响颇大，但究根诘底不过是一件很无聊的事。但是越是无聊越能反映出当时官场的无聊。大家热衷党争，不干正事，内耗非常严重。百姓生计、经济、边防被认为是无聊的小事。无聊的立长立幼问题被看做大是大非压倒一切的原则性问题。为了所谓的“国本”，这帮家伙喋喋不休地争论了十几年。
万历把全部精力放在敛财上面。他把太监派往全国各地担任税使、矿监。这些税使、矿监在地方横行霸道，无恶不作，滥施淫威，科敛无度，丝毫不顾百姓死活。民变因此多发。
不断有人上书万历要求召回祸乱天下的税使、矿监。万历不理。
1601年，皇长子朱常洛大婚。这事又挑起群臣要求册立太子的请愿高潮。太后也急了，催促万历赶紧立太子。你这都快当爷爷了，太子还没立呢，等什么呢？
万历本想等病怏怏的皇后死了立郑贵妃为皇后，让三儿子顺理成章成为嫡子，进而立为太子。但皇后一直半死不活地挺到现在，似乎还能继续挺下去。万历实在没辙了，同意立朱常洛为太子。
长达16年的“国本之争”最终以万历的妥协而告终。群臣皆大欢喜。
郑贵妃得知万历准备立朱常洛为太子，拿出一个宝盒，里面装着万历当年写的那份保证书。她打开盒子一看，保证书早已被虫子咬烂，放声大哭。万历很迷信，认为这是天意，拿定主意立朱常洛为太子。
万历既然已经准备立朱常洛为太子，开始修补父子关系。他决定把朱常洛的大婚办得风风光光。他让人去户部支银子采办珠宝。户部说宫里这两年买珠宝支走了两百多万两白银，我现在这库里只剩下一千多两。万历让户部自己去想办法，反正得把钱给我送过来。户部能想什么办法？只能加税呗。羊毛出在羊身上。最终倒霉的都是老百姓。
朱常洛大婚，花了二百万两白银。
朱常洛那边打发了，他也不能亏待郑贵妃的儿子。他封郑贵妃的儿子朱常洵为福王，赐庄田4