国民党领袖宋教仁被刺案是民国时期乃至中国近代史的一个大案，也是一个迷案。
究竟是谁杀了宋教仁至今众说纷纭。
刺杀案发生后震惊全国。
袁世凯下令上海警方全力缉拿凶手。
刺杀案发生在上海租界。租界警方很快抓到刺客。刺客叫武士英，是一个落魄的退伍军人。从武士英身上搜出一张名片，上面写着上海青帮老大应桂馨的大名。警方反手又抓了应桂馨。
也有说法是知情人告发应桂馨雇凶杀人。警方先抓了应桂馨，后抓的武士英。
总而言之，杀害宋教仁的凶手都被抓到了。
但是凶手移交中方警察后，武士英得急病死在了狱中，应桂馨在帮会同伙的帮助下越狱而逃。案子转眼又成了无头案。
警方搜查应桂馨的家，搜出一叠电报，是应桂馨跟国务秘书洪述祖的来往电报。电报虽然在关键之处都使用暗语，但能看出来应桂馨是替洪述祖办事的。有理由怀疑，刺杀宋教仁是受北京方面的指使。
但是洪述祖闻讯逃走使破案线索再次中断。这案子审不下去了，只能暂时作为悬案挂起来。
民间对此案议论纷纷，什么说法都有。
洪述祖没有杀宋教仁的动机。杀了宋教仁对他没有任何好处。他一定也是奉命办事。
那他又是奉谁的命令呢？洪述祖的顶头上司是赵秉钧。宋教仁谋求内阁总理职位，对赵秉钧构成直接威胁。所以赵秉钧有杀宋教仁的动机。但是赵秉钧的顶头上司是袁世凯。宋教仁是袁世凯的政敌。袁世凯也有杀宋教仁的动机。那么到底是谁要杀宋教仁呢？
袁世凯在很长一段时间里被人认定为杀害宋教仁的幕后黑手。有人把猜测作为事实，说袁世凯指使手下谋杀了宋教仁，并且杀人灭口把包括赵秉钧在内的知情人全部谋杀。虽然作为“窃国大盗”，袁世凯清除障碍为称帝铺路似乎合情合理，但毕竟没有证据证明袁世凯做了这些事。
从应桂馨那里搜出一封电报，上面提到了袁世凯的名字。这封电报被一些人当做袁世凯参与谋杀的证据。
这封电报是洪述祖发给应桂馨的，上面说应桂馨从日本搞到了同盟会两巨头黄兴和宋教仁的丑闻（诸如黄兴和妓女的合影、宋教仁被诉诈骗罪的传票），“总统阅后颇喜”。
这封电报也许能证明应桂馨、洪述祖是为袁世凯做事，但不能证明袁世凯就是杀害宋教仁的幕后黑手。搜集国民党党魁的黑材料只能说明袁世凯这人不厚道，说明不了别的。搜集政敌的黑材料然后抹黑对方是议院斗争的常见手段。美国总统竞选也经常出现互相泼脏水的情节。美国总统尼克松为了搜集政敌情报不仅搞窃听还整出一个著名的“水门事件”。但是杀人这种极端手段很少被采用，风险太大。
被查获的电报里有一封洪述祖给应桂馨布置任务的电报，任务是“毁宋