河南一带、准备守住黄河防线，以备清军渡河来攻的计划，就此彻底落空，成为泡影。
而对于清廷来说，许定国杀其主将率部来降的消息，无异于上天上掉了块大馅饼。
因为当时，清廷重兵尚在陕甘一带追剿顺军残部，整个黄河北岸，只有不到一万人的军队，势力十分薄弱。而由于许定国部的叛变加入，竟使清兵势力增加四倍以上，对南明的威胁程度，迅速提高了几个数量级。
至此，清军在河南到山东一带，从此再也没有强劲的对手，整个中原地区的势力对比，已然完全改观。
而此消彼长，这睢州之变发生后，南明朝廷也再也没有能力与兵马，去组织与清虏角逐中原的大规模战争，甚至想要凭黄河而守，都基本不可能了。
这样的变化，对于南明来说，堪称是一个致命的打击。