“全外显子测序”,结果显示,患者有一个casp10的基因变异,这个孩子的casp10有4个外显子全部丢失,预计所产生的蛋白质会没有功能。
已知casp10变异可以导致一种叫做“自身免疫性淋巴细胞增生综合征的疾病,该病属于常染色体显性遗传病,机制是淋巴细胞凋亡受阻,导致异常的淋巴细胞增生,从而导致自身免疫和淋巴增生表现,包括中性粒细胞减少等。
而已知casp10是促进细胞凋亡的基因,casp10的致病变异可以让细胞凋亡过程受阻,导致alps这个疾病,而且还是常染色体显性遗传。
这个孩子的casp10基因4个外显子全部丢失,预计基因功能会完全丧失,诊断alps似乎是顺理成章的事情。这也是基因检测报告的意见,国内的大医院医生也是这样认为。
但是,这里却有两点不对劲。
一方面,文献搜索casp10这四个外显子缺失,发现日本报道了一个家庭,父亲和两个孩子三口都有这四个外显子缺失,却没有一人患上alps,而只有一个孩子得了关节炎,里面集合了20万人的基因组数据信息,并且根据这些信息做了很多有意义的分析。
在gnomad数据库上,我发现casp10这个基因,人群中有较高比例的人有着预测可以导致功能完全丧失。
意思是说,一个人有两条染色体,每条常染色体上有分别来自父母的一套相同的基因,这上面如果某个基因即使完全失去功能,只要另外一个没问题,对个体健康就不会有影响。
也就是说casp10这个基因,人群中本来就有不少人(两个基因之一)是完全没有功能的,而这些人完全健康。
所以问题来了,casp10的致病变异是怎么导致alps的,为啥这个病还是常染色体显性遗传病?
继续深入的查了一下文献,原来casp10的致病变异导致alps的机制是dominantnegativeeffect(“显性负效应”),而不是haploinsufficiency(“单倍不足”)。
haploinsufficiency的意思是说,当一个人来自两个染色体的两个相同基因中,如果有一个功能完全丧失的话,只有另外一个是不够用的,会导致疾病。
上面通过人群基因数据的推导也显示,casp10致病基因导致alps并非这种情况。
也就是说,casp10这个基因,如果其中一条染色体上该基因的功能完全丧失,是不会导致疾病的;反而是如果其中一条染色体上该基因的功能部分丧失,而且丧失的是某一特定的关键功能,则会导致疾病。
有人也许会好奇,如果casp10基因两个染色体上的功能都全部丧失会怎么样?虽然目前并没有这样的病例报道,但考虑该基因对关键生理过程的重