袭扰晋境。孝武帝见朝中再无大将，心甚忧虑，遂向朝中诸臣求计。群臣奏道：“请陛下降诏，求文武良将具有才略者，命各郡举荐入朝，委以重任，使其镇御北方，则江南安宁。”孝武帝从之，于是颁诏天下，求荐文武良将。谢安出班奏道：“臣举一人，有万夫不当之勇，鬼神不测之谋，若以其为将，镇守北边，则秦军必不敢正觑我江南。此人乃臣兄谢奕之子谢玄，字幼度。先与郗超同为丞相桓温参军，桓温多用其智，屡建大功。今桓温既死，其与郗超皆归还朝廷，供职班中。臣举贤不敢避亲，若使其总镇江北，管取边界安宁。”孝武帝准其奏请，于是召谢玄上殿，慰抚道：“今秦兵节次犯境，卿叔父谢安荐卿有文武之才，朕纳其荐，拜卿为建武将军，监江北诸军事，总领沿江诸镇，屯守北岸。其责重于泰山，非同小可，惟贤卿用心调度，勿负朕望。”谢玄奏谢道：“臣本驽钝，不足以驰骋千里。今蒙陛下破格擢用，敢不尽力，使出镇之地莫不保全！”于是领职受印，辞帝下殿而出。
且说谢安叔侄俱各受封重职，恼了中书郎郗超，愤然不悦。郗超以其父郗愔乃是名公郗鉴之子，位遇应在谢安之上，但一直处于闲职，而谢安却能掌握朝政，对此早就愤恨不平。今闻其从侄谢玄又掌兵权，更增忿闷，遂俨然成疾。有好友前来探病，问道：“今谢公举其侄领兵，公谓谢玄不能胜其任乎？”郗超虽与谢玄不和，但仍客观答道：“以谢安之明，乃能违众举亲。以谢玄之才，复定能成功，不负所举。我与谢玄曾在桓丞相军府共事，见其用人能各尽其才，即使履屐之间小事，亦能使人得其所任。以此推断，故知其定能建立功勋。”好友喟叹而别。郗超由此与谢安构隙，谢安对郗超也是深恨不已。郗超因守母孝而致仕在家，后孝服期满，朝廷起复其为散骑常侍，后又授为宣威将军、临海太守。郗超因所授官职位于谢玄之下，故称病而拒不接受。太元二年十二月，郗超郁郁而终，年仅四十二岁。
郗超死后，岳父欲接女还家，其妻周氏坚拒说道：“某生虽不能跟郗郎同室而居，则死后愿与夫同穴而葬。”闻者无不动容。郗超曾出任桓温参军，但桓温三次北伐皆不用郗超之谋，故致大败，乃成千古遗恨。郗超又参预桓温废立密谋，势焰嚣张，骄横跋扈，连谢安在内朝中大臣等均畏其势。桓温死后郗超失势，但欲借其父之势复起，故常视谢安为政敌。其父郗愔好财，曾聚敛钱财数千万，郗超在向父亲请安时，故将话题引至钱财。郗愔笑道：“闻子之语，不过想得我钱财而已！”于是打开钱库，许郗超任意取用。不意郗超竟在一日之内，将库中钱财悉数分给亲戚朋友，郗愔惊怪不已。郗愔忠于王室，政见与郗超相左，并对郗超与桓温图谋篡晋之举丝毫不知。郗超临终前将一箱书信交给门生，嘱道：“我死之后，若父亲悲伤过度，伤害寝食，可将此箱书札呈交观之。若我父不悲，则焚之可也。”郗超死后，郗愔果因悲痛不胜患病。门生便将书札呈之，郗愔发书看时，见其皆是与桓温密谋篡位书信。郗愔于是由悲转恨，大怒道：“如此逆子，何死如此晚耶