挫百官，威权无两，这才强行将太学五科定制下去。
尽管如此，太学祭酒杨儒仍采取了一种讨巧的法子，在明经科的下面又分了好几种学官，分别用来讲授《尚书》、《易》等经书，所以明经科相比于其他科目，所拥有的博士是最多的。往往都是比照五经博士的成例，一份经书配一个博士，而其他的科目最少的只有一个博士。
明经科因为上有太学祭酒杨儒背书，下有许多成名已久的博士坐镇，导致明经科成为太学最显赫的科目，太学生皆以入明经为荣。不仅如此，每每开课，常引起那些被强行调剂到其他科的士子们跑来旁听，明经科由此也被称为太学中的太学。
底下的执行者走迂回的路子抵触皇帝的政策，虽不至于明面抵抗，但这也让皇帝极为不满。但他也没有办法，毕竟他手上一时没有能挑起大梁、能孚众望的御用大儒，所以撤了一个杨儒，换谁上去都一样。这是风气问题，而移风易俗，更改固化已久的意识形态，却又是这世上最难办的事情。
皇帝一开始还想着在太学祭酒与太学仆射之上设立太学令，把郑玄摆到这个位置上去，让他统筹太学所有事务，借助他名著海内的威望与远超当代的学识，能把风气扭转到皇帝所预想的方向上去。毕竟从郑玄融汇古今经学与百家之长的成就来看，对方绝不是一个泥古不化的人，没准能被皇帝说服，认同皇帝五科并重的观点。
可现在从郑玄的态度中，皇帝发现，原来思想再开明的人，也有他的局限性。