为主，次论蜀为冲要之地，宜加强军备。当时史弥远操纵台谏，控制言路，其同伙薛极、胡榘大行其道，真德秀多次上书抨击弊政，与袁燮、柴中行相应和，激怒史弥远，于是被任命为金国贺登位国信使。真德秀走到盱眙，恰逢金都大乱，的道路不通，滞留边境两月而返。期间真德秀遍观两淮山川形势，咨访军民疾苦，大有筹划经营之志。
嘉定七年春正月，真德秀返回都城。上殿细说路途见闻，权衡了宋、金、蒙三方的关系后，称金国以南京为首都，说明金国已经形势危急，则岁币可以停止。他认为金人移都汴京甚可忧虑，继而旁征经史及本朝故事，认为苟安并非良策。
权臣史弥远以爵禄笼络朝臣士子，真德秀看到史弥远并非想振兴图强，而只是在执政之初，采纳理学人士刘爚的建议，崇尚理学，收买人心。他不满地对刘爚说道：“吾徒须急引去，使庙堂知世亦有不肯为从官之人。”虽然史弥远挽留，但真德秀去意坚决。同年十一月，真德秀出任江东路转运副使。
刚一上任，真德秀就访问民疾，施行惠政。因为宣城县遭受了潦伤，又遇旱灾，他上奏乞求豁免去岁零苗。他见江宁县城南厢居民因流亡憔悴，同安抚司上奏乞求妥善安排。他巡历至黄池镇，百姓数千人拦路，控诉史弥远的亲属史弥迥侵凌违法诸事。他命僚属查得事实，上奏弹劫，并申乞罢黄池镇行铺。他离开广德时，有百姓数千人相送，有人指着道旁的许多坟墓哭泣着告诉他，说道：“此皆往岁饿死者。微公，我辈已相随入此矣。"
嘉定十一年正月初一日，史弥远生日，门人争为歌功颂德。官吏竞献瑰奇靡丽，真德秀上书规讽，并以诸葛亮之道德功业告诫。海盗侵犯泉州，真德秀令左翼军前去收捕，听说拨发官进勇副尉王大寿奋力战死，于是作文祭奠之，并厚恤其家。因为他肃清海盗有功，朝廷特赐转一官。
嘉定十二年，真德秀升知隆兴府兼江西安抚使。离任时，真德秀以治泉得失问于僚属，李方子用"尽己之忠"、"不息之诚"来回答他。真德秀又奏请治兵选将、缮城饵盗等便民五事。还没来得及施行，母亲吴氏就因病逝世，他丁忧归故里。宋宁宗去世，史弥远以宗室赵贵诚改名赵昀继位。朝廷召回真德秀，任命他为中书舍人兼侍读。两天后，升改为礼部侍郎兼直学士院、侍读。真德秀对史弥远擅权废立不满，一再辞免新命，迟迟不赴任。直到同年十二月，他才离潭州，请假便道回家乡浦城休假。并再辞新命，请求依旧任地方官。
真德秀赴任途中时，史弥远派使者杨迈警告他不要提及废立之事。真德秀到达临安，得知济王赵竑已被史弥远害死时，更加不满。一月之间四辞直
学士院，终于辞去直学士院而只任礼部侍郎，并一再为济王辩解。史弥远深觉真德秀的名望对自己产生威胁，又因为在对济王赵竑追赠方面与其意见不合而受到史党给事中王塈、盛章攻击，因而又三次自请黜责。