地归卫所拥有。
三、清算前段时年占有卫所田地的税收并追究非法的买卖卫所田地的问题。
这些法令虽然在朝堂上通过了，但还是经过残酷斗争的而来，其所以能够通过，主要是总后勤部，接管了文官政府的大部分粮钱。原先文官政府掌管的大部分钱粮必须交给总后勤部运送和管理，也就是失去了大部分地区钱粮的漂没的提成。即然文官系统失去了钱粮的过手权，只有小部分的九边的其它利益也就争夺不那么激烈。
文官也清楚，九边人口少，钱米不多，更清楚，九边与边防相关。极端自私，追求财富而不顾边防的极端官吏少，在临危投敌的人也不多。
其后不久也通过了卫所田制的有关法令，卫所制涉及全国大部分地方的卫所，其内容比照九边的法令，法令的主要内容是卫所的原屯田的所有田地收归卫所所有。
大明南部中部的卫所，部分在城镇附近，部分在偏远的地方，偏远地的田地，大户占窝现象少。
这些法令的通过，实质上是文官政府放弃的九边和卫所的管理权，卫所屯田的管理权由文官转移到武将系统。武将系统实质上就是皇帝系统，九边和卫所的军事和民政都是皇帝系统管理。孙承宗虽然是总参谋长，主要管理天下的军事训练与调度，且从不与皇帝争权。
事情发展现在，崇祯在总参谋部，总后勤部，总装配部之外又成立了屯田部。
九边和卫所屯田的主要问题是武官占田的现象较为普遍。
九边区域设置的卫所较普遍，卫所几乎取代的乡村行政机构，九边之外的其它地区的卫所则较少，卫所之田与民田相交错不多，卫所并不和其它地方争生存空间。就是到了现代的上山下乡时代在云南、海南岛建了那么多农场都没有出现过土地紧张局势。
卫所的军官必须在卫所，军官就利用权力，在几百年的时间里，抢占卫所的田和抢占军户的劳动成果。
面对较为普遍的军官占田现象，能不能管，可不可能整顿，这是一个时代的选择问题，也是一个生死存与死亡的选择问题。
现在的此崇祯掌握下的皇帝系统，肯定要管。南部中部地区用新军代替旧屯田军，九边也准备了一批新军，现在到了全面接管九边的时期了。
最开始接管九边时，崇祯在派往九边的工作队的学习班说，工作的重点是接管九边，九边的重点又是田地收归卫所所有，然后公平的分给军户耕种。
原先的田主主动退缩者，甚至不敢认领田地者，就不要再去找模烦了，向占田户追收税收的法令，只是对占田大户的威慑方法，追收税收的法令，可以执行，也可不执行。
有的土豪或武官来相争，则必须针锋相对，必要时可以动用武力，就是闹到操其家也不怕。官司打到朝庭，打到朕这里，你们也不会输。能够简单处理的，就不要去复杂化，能够不动武的尽量不要动武，