进五退，最终还是溃败下来。
清军扎营盘树壁垒挖壕沟，把昆明团团围住。
半年后，昆明粮尽援绝被清军一举攻陷。吴世璠兵败自杀。
历时八年的反清复明运动终于烟消云散。
“三藩之乱”平息后，康熙以谋反罪杀了尚之信、耿精忠，取消了藩镇。其他参加“三藩之乱”而后又投降清军的叛将也都没落了好下场。
康熙拿下三藩后，一面休整部队，一面琢磨攻取台湾。台湾是他实现大一统国家、大一统皇权最后一个障碍。
郑经败退回台湾后得病而死。他临死时把王位传给长子郑克臧。但是次子郑克塽[shuang]的岳父冯锡范想让女婿继承王位，于是发动政变，杀死郑克臧，把郑克塽推上王座。政变使台湾政局混乱，人人思危，离心离德，军心涣散。
“三藩之乱”就因为内讧不断而失败。台湾仍不知道吸取教训。明朝包括南明之所以灭亡，内耗严重是一个重要原因。明朝不是败给清朝，而是败给了自己。
康熙得知郑经死了，台湾政局不稳，认为时机已到，下令进攻台湾。
1683年，清军将领施琅率领两万水军突袭台湾的西大门澎湖列岛。
施琅本是郑成功手下一员虎将，因为和郑成功闹翻，投降了清兵。他擅长水战并且对郑家军知根知底。
施琅杀至澎湖，把兵力分为东西两路，西路佯攻吸引郑家军的注意力，东路迂回到澎湖后面发起强攻。郑家军腹背受敌，很快溃败。守军向清军投降。
澎湖战败震惊了台湾本岛。郑克塽急召群臣讨论战守之策。大家对战和守都没有信心，倾向于逃和降。
台湾在康熙下达禁海令后，各种补给成了问题。台湾在那时就是外向型经济，岛内资源匮乏、人口稀少，对大陆依赖性比较强。台湾被封锁后，别说经济连吃饭都成了问题。士兵的士气大受影响。
更为影响士气的是士兵的思乡情绪。郑家军都来自大陆，离家愈久思乡愈甚，尤其感觉反攻大陆已然没戏，有心投降清朝回家团聚。士兵接连不断叛逃大陆。
康熙在澎湖之战后向台湾摇橄榄枝。台湾于是借坡下驴宣布投降。
郑克塽率领台湾军民剃发易服归顺了清朝。台湾也从此划入清朝版图。
中国自此被清朝统一。