帮小党组成，不一定都听宋教仁的，想拿到三分之二多数也不是那么容易的事。
那时候的党的概念还很模糊。对于很多人来说，建党入党只是一个升官发财的机会。以前知识分子通过科举做官，现在没科举了，只得通过入党谋个一官半职。党的分分合合也说明了大家没有什么政治原则，都是为利而来，为利而去。如果有人使用威胁利诱的手段，议员会出于趋利避害的考虑会选择屈从。就像当时军方威胁要解散国会时，议员赶紧通过了内阁名单。
袁世凯手里掌握着实力最强的北洋军，控制着首都。在袁世凯的手心里跟袁世凯作对，议员得有足够的胆量。宋教仁即便够胆，手下议员不一定够胆。所以袁世凯不必对宋教仁乃至国民党担心，也没有太大必要杀宋教仁。
宋教仁对袁世凯的地位暂时构不成威胁，但对内阁总理赵秉钧却构成了实实在在的威胁。宋教仁主张总理应该国会推选而不是总统指定，并且准备以第一大党领袖的身份出任总理。这意味着赵秉钧的总理做到头了。
大家因此怀疑，赵秉钧可能为了保住总理的位子对宋教仁下了毒手。
当时社会上普遍怀疑赵秉钧。从应桂馨那里起获一本电报密码本，经查是赵秉钧给的。并且在一封电报里，赵秉钧跟应桂馨以兄弟相称，虽然没提刺杀的事但至少是在直接安排应桂馨去做什么事。应桂馨在刺杀宋教仁前后给洪述祖发过四封电报，通告刺杀计划及刺杀成功的消息，里面有“乞转呈候示”、“请先呈报”等语。应桂馨让洪述祖“呈”给谁？最大的可能就是赵秉钧。至于赵秉钧是否需要进一步呈报不得而知。
赵秉钧跟大家坦白，那人是我的特派员，我给他密码本很正常。他雇凶杀人跟我没关系。但是大家不信。
当时国民党控制着上海。上海警察局传唤赵秉钧来上海接受审讯。赵秉钧不肯去。这更加深了人们对他怀疑。
赵秉钧百口莫辩，只得辞职隐居。袁世凯任命段祺瑞接替他做内阁总理。
其实当时也有人怀疑孙中山是幕后黑手。因为刺客武士英是共进会成员。共进会的会长是应桂馨。应桂馨出身青帮，做过陈其美的谍报科长、孙中山的总统府卫队司令。两人跟国民党（同盟会）有着千丝万缕的联系。并且洪述祖和赵秉钧虽然是袁世凯的部下却跟国民党关系密切。“黄兴宣称赵秉钧及全体国务员加入国民党”。赵秉钧的总理一职就是黄兴向袁世凯推荐并获得参议院通过的。这也就是说刺杀宋教仁的相关人员都是国民党那条线上的人。袁世凯使用国民党那条线上的人去杀国民党的党魁有些说不通。孙中山找他们做这件事才显得顺理成章。也就是说宋教仁死于国民党内讧。
孙中山为什么杀宋教仁？很简单，孙中山跟宋教仁也是政敌。宋教仁跟袁世凯争总统、跟赵秉钧争总理的同时跟孙中山争国民党的老大。孙中山是被宋教仁排挤出国民党的。孙中山能不恨他？
但是孙中山