反，国内叛乱纷起。
大将陈显达发动军事政变，率军杀往建康，意欲废立皇帝。陈显达连战连胜杀到建康城下，一时大意被人刺翻马下，功亏一篑。他的部下被官军抓住斩首时坚称自己是义军，是为了让百姓免于涂炭而起兵。
寿阳守将裴叔业在陈显达叛乱时没有积极出兵参加平叛，受到萧宝卷的猜忌。他把儿子送去京城做人质也不能平息萧宝卷的杀心，情急之下举城投降了北魏。北魏军队轻而易举占领了淮河以南。
萧宝卷派老将崔慧景和萧懿率领水陆两军去夺回寿阳。
崔慧景看着朝中的老人越来越少，知道萧宝卷延续了萧鸾清洗前朝老臣的政策，担心自己也不能幸免。他率军北上途中召集众将开会，称：萧宝卷昏庸残暴危及社稷。我想率军回京匡扶社稷，不知大家意下如何？众将齐声响应。于是崔慧景率军反戈一击杀向建康。
当时萧宝玄镇守在京口。崔慧景派人联络萧宝玄，以拥立萧宝玄为条件换取萧宝玄合作。萧宝玄于是打开城门迎入崔慧景。两人合兵一处杀向建康。
崔慧景率军杀入建康包围了皇宫。萧宝卷一面死守宫城，一面派人急诏萧懿回京勤王。萧懿是萧宝卷的族叔。萧懿率兵驰援驱散了叛军。崔慧景和萧宝玄先后被杀。
萧懿救驾有功被升为尚书令，位列百官之首。但是萧宝卷很快对他也起了疑心，一杯毒酒将他害死。他对谁起疑就杀谁，从来不审不问，以免夜长梦多。
他把清洗崔慧景、萧宝玄、萧懿一党的工作交给亲信去做，自己继续沉溺于玩乐。
他的亲信都是靠溜须拍马上位的邪佞之辈，对上阿谀奉承奴颜卑色，对下阴险狡诈贪婪残暴。他们以追查叛党为名肆意扩大打击面，查抄富户，杀人越货。京城内外人心惶惶。
宫内失火，烧毁房屋三千多间，烧死宫人无数。萧宝卷闷闷不乐。那些邪佞之辈为哄他开心，劝他趁这机会重新装修宫殿。旧的不去新的不来。原先的宫殿早已陈旧不堪，烧就烧了，咱们正好修新的。萧宝卷果然转怒为喜，开始大兴土木，极尽奢华地装修宫殿。重修的宫殿不仅雕梁画柱，连墙壁都有雕刻绘画之类的装饰，并且还用麝香涂抹，好看又好闻。
他用凿成莲花式样的金砖铺地，让他最宠爱的小脚美人潘玉奴在上面姗姗而行，欣赏玉足金莲交相辉映。他还大发感叹：“仙子下凡，步步生莲”。以后人们就用“金莲”来形容女人的小脚。
他对工程进度催得非常紧。工匠们日以继夜的工作。运送材料的民夫络绎不绝。官吏层层加码对百姓横征暴敛。“百姓困尽，号泣道路”。
萧宝卷对宫外的事情漠不关心，一味玩乐。他在宫中设立了一个模拟市场，让太监卖肉，宫女卖酒，潘妃扮演市令（相当于工商管理部门）解决纠纷，领着一大帮子人过家家玩。
萧懿的弟弟萧衍得知哥哥的死讯，知道自己也难以幸免，