，而是直接奔杨府，将杨秀清一家老小全杀了。他杀完人拎着杨秀清的人头进宫请功。
洪秀全责备他说：我让你去抓人没让你去杀人。你不分青红皂白就把杨秀清杀了，他手下的人能干吗？
韦昌辉说这好办，扭头出去了。他带兵包围了杨秀清的直属部队，假传圣旨让他们缴械。等他们缴械之后，他下令把他们全杀了。一声令下杀了两万多人。
这时石达开赶到，见到这个情况责备韦昌辉滥杀无辜。俩人话不投机，不欢而散。
韦昌辉越想越郁闷。我为你们除了一害，没落着好反倒落了一身不是。杀红了眼气昏了头的韦昌辉派人去杀石达开。所幸石达开腿快，翻越城墙而跑。韦昌辉杀了石达开全家泄愤。
气消了的韦昌辉发现自己闯下大祸。杀了杨秀清，得罪了洪秀全、石达开，这在太平天国还怎么混？他原本想杀了杨秀清能够取而代之，现在看来已是不可能的了。
狗急跳墙的韦昌辉一不做二不休带兵攻打皇宫。做二号人物不成，我干脆做一号人物。
天京的太平军一看，韦昌辉疯了，逮谁咬谁，一拥而上把韦昌辉给灭了。
石达开带兵回来报仇，驻兵城外，准备攻打天京。洪秀全忙叫人拎着韦昌辉的脑袋去见石达开说明情况。石达开随即罢兵，进京来见洪秀全。
石达开回京，合朝欢呼，众望所归。洪秀全顺应民意，让石达开“提理政务”，主持军国大事。
五王死了四个，按说石达开顺位成了二号人物。但经此内乱，洪秀全觉得石达开也不是能够信得过的人。他提拔年轻将领李秀成与石达开同掌兵权，提拔两个哥哥洪仁发、洪仁达为王与石达开同掌政权。
石达开发现自己被架空非常不满，同时又对洪秀全的无端猜忌非常不安。这家伙一气之下带兵出走，跟洪秀全决裂了。
石达开率军远征四川，想仿效张献忠闭关为王。但路过湖南的时候被湘军截住，于是掉头南下回广西老家。但广西太穷了，在南京享受过荣华富贵的部下不愿再过苦日子了。虽说金窝银窝不如自己的土窝，但真住上金窝银窝谁还肯回到自己的土窝？将士陆续脱离石达开转回天京。石达开无奈只得离开家乡再次进军天府之国。
石达开取道贵州向四川进发。一路上被地方武装袭击、被清兵围追堵截，队伍越打越少，还没到四川就已经损失大半。石达开看这情况打四川没戏，径直走入清军阵营请求投降。他跟清军讲好以自己的命换部下的命。但清兵不想留后患，在石达开的军队缴械后把他们全部屠杀。
天京之乱期间，清军并没有趁火打劫发动全面反攻。这是因为清朝发生了比天京之乱更严重的问题，那就是第二次鸦片战争。